Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK1EP49674 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms