Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPFP49454 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPFP49454 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPFP49454 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPFP49454 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPFP49454 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPFP49454 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPFP49454 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPFP49454 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPFP49454 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPFP49454 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPFP49454 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPFP49454 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPFP49454 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPFP49454 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPFP49454 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPFP49454 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPFP49454 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPFP49454 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPFP49454 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPFP49454 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPFP49454 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPFP49454 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPFP49454 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPFP49454 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPFP49454 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPFP49454 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPFP49454 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPFP49454 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPFP49454 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPFP49454 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPFP49454 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPFP49454 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPFP49454 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPFP49454 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPFP49454 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPFP49454 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPFP49454 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPFP49454 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPFP49454 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPFP49454 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPFP49454 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPFP49454 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPFP49454 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPFP49454 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPFP49454 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPFP49454 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPFP49454 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPFP49454 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPFP49454 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPFP49454 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPFP49454 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPFP49454 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPFP49454 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPFP49454 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPFP49454 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPFP49454 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPFP49454 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPFP49454 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPFP49454 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPFP49454 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPFP49454 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPFP49454 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPFP49454 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPFP49454 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPFP49454 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPFP49454 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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CENPFP49454 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPFP49454 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPFP49454 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPFP49454 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPFP49454 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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CENPFP49454 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPFP49454 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPFP49454 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPFP49454 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPFP49454 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPFP49454 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPFP49454 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPFP49454 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPFP49454 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPFP49454 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPFP49454 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPFP49454 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPFP49454 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPFP49454 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPFP49454 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPFP49454 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPFP49454 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPFP49454 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPFP49454 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPFP49454 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPFP49454 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPFP49454 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPFP49454 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPFP49454 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPFP49454 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPFP49454 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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