Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FNTBP49356 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FNTBP49356 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FNTBP49356 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FNTBP49356 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FNTBP49356 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FNTBP49356 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FNTBP49356 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FNTBP49356 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FNTBP49356 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FNTBP49356 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FNTBP49356 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FNTBP49356 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FNTBP49356 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FNTBP49356 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FNTBP49356 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FNTBP49356 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FNTBP49356 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FNTBP49356 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FNTBP49356 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FNTBP49356 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FNTBP49356 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FNTBP49356 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FNTBP49356 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FNTBP49356 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FNTBP49356 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FNTBP49356 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FNTBP49356 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FNTBP49356 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FNTBP49356 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FNTBP49356 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FNTBP49356 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FNTBP49356 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FNTBP49356 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FNTBP49356 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FNTBP49356 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FNTBP49356 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FNTBP49356 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FNTBP49356 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FNTBP49356 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FNTBP49356 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FNTBP49356 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FNTBP49356 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FNTBP49356 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FNTBP49356 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FNTBP49356 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FNTBP49356 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FNTBP49356 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FNTBP49356 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FNTBP49356 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FNTBP49356 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FNTBP49356 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FNTBP49356 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FNTBP49356 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FNTBP49356 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FNTBP49356 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FNTBP49356 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FNTBP49356 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FNTBP49356 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FNTBP49356 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FNTBP49356 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FNTBP49356 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FNTBP49356 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FNTBP49356 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FNTBP49356 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FNTBP49356 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FNTBP49356 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FNTBP49356 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FNTBP49356 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FNTBP49356 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FNTBP49356 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FNTBP49356 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FNTBP49356 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FNTBP49356 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FNTBP49356 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FNTBP49356 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FNTBP49356 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FNTBP49356 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FNTBP49356 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FNTBP49356 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FNTBP49356 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTBP49356 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTBP49356 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTBP49356 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTBP49356 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTBP49356 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTBP49356 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTBP49356 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTBP49356 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTBP49356 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTBP49356 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTBP49356 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTBP49356 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTBP49356 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTBP49356 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTBP49356 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTBP49356 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTBP49356 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTBP49356 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTBP49356 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms