Protein–RNA interactions for Protein: P48736

PIK3CG, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit gamma isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CGP48736 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CGP48736 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms