Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PIP4K2AP48426 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms