Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GNPDA1P46926 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms