Protein–RNA interactions for Protein: P42857

NSG1, Neuron-specific protein family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSG1P42857 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NSG1P42857 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NSG1P42857 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NSG1P42857 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NSG1P42857 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NSG1P42857 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NSG1P42857 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NSG1P42857 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NSG1P42857 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NSG1P42857 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NSG1P42857 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSG1P42857 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSG1P42857 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NSG1P42857 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSG1P42857 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSG1P42857 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSG1P42857 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSG1P42857 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSG1P42857 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSG1P42857 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSG1P42857 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSG1P42857 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSG1P42857 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSG1P42857 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NSG1P42857 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSG1P42857 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSG1P42857 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSG1P42857 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSG1P42857 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NSG1P42857 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NSG1P42857 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSG1P42857 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSG1P42857 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSG1P42857 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSG1P42857 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSG1P42857 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSG1P42857 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSG1P42857 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSG1P42857 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSG1P42857 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSG1P42857 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSG1P42857 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSG1P42857 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSG1P42857 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSG1P42857 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSG1P42857 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSG1P42857 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSG1P42857 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSG1P42857 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSG1P42857 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSG1P42857 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSG1P42857 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSG1P42857 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSG1P42857 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSG1P42857 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSG1P42857 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NSG1P42857 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSG1P42857 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSG1P42857 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSG1P42857 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSG1P42857 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSG1P42857 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSG1P42857 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSG1P42857 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSG1P42857 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NSG1P42857 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSG1P42857 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSG1P42857 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NSG1P42857 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSG1P42857 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NSG1P42857 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NSG1P42857 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NSG1P42857 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSG1P42857 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSG1P42857 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSG1P42857 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSG1P42857 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSG1P42857 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSG1P42857 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSG1P42857 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSG1P42857 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSG1P42857 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSG1P42857 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSG1P42857 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSG1P42857 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NSG1P42857 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NSG1P42857 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NSG1P42857 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NSG1P42857 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NSG1P42857 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NSG1P42857 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NSG1P42857 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NSG1P42857 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NSG1P42857 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NSG1P42857 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NSG1P42857 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NSG1P42857 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NSG1P42857 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NSG1P42857 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NSG1P42857 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms