Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5CP41229 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms