Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms