Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms