Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms