Protein–RNA interactions for Protein: P24821

TNC, Tenascin, humanhuman

Predictions only

Length 2,201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNCP24821 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNCP24821 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNCP24821 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNCP24821 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNCP24821 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNCP24821 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNCP24821 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNCP24821 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNCP24821 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TNCP24821 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNCP24821 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TNCP24821 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNCP24821 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNCP24821 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNCP24821 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TNCP24821 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TNCP24821 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNCP24821 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNCP24821 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNCP24821 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNCP24821 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TNCP24821 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNCP24821 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNCP24821 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNCP24821 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TNCP24821 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNCP24821 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNCP24821 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNCP24821 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNCP24821 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNCP24821 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNCP24821 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNCP24821 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNCP24821 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNCP24821 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNCP24821 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNCP24821 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNCP24821 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNCP24821 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNCP24821 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNCP24821 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNCP24821 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNCP24821 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNCP24821 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNCP24821 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNCP24821 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNCP24821 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNCP24821 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNCP24821 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNCP24821 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNCP24821 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TNCP24821 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TNCP24821 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNCP24821 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TNCP24821 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNCP24821 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNCP24821 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNCP24821 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNCP24821 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNCP24821 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNCP24821 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNCP24821 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNCP24821 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNCP24821 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TNCP24821 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNCP24821 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNCP24821 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNCP24821 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNCP24821 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNCP24821 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNCP24821 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNCP24821 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNCP24821 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNCP24821 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNCP24821 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TNCP24821 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNCP24821 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNCP24821 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNCP24821 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNCP24821 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNCP24821 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNCP24821 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNCP24821 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNCP24821 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNCP24821 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNCP24821 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNCP24821 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNCP24821 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNCP24821 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNCP24821 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNCP24821 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNCP24821 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNCP24821 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNCP24821 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNCP24821 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNCP24821 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNCP24821 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNCP24821 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNCP24821 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNCP24821 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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