Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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