Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms