Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms