Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DESP17661 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DESP17661 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DESP17661 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DESP17661 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DESP17661 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DESP17661 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DESP17661 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DESP17661 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DESP17661 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DESP17661 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DESP17661 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DESP17661 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DESP17661 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DESP17661 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DESP17661 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DESP17661 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DESP17661 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DESP17661 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DESP17661 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DESP17661 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DESP17661 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DESP17661 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DESP17661 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DESP17661 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DESP17661 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DESP17661 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DESP17661 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DESP17661 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DESP17661 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DESP17661 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DESP17661 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DESP17661 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DESP17661 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DESP17661 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DESP17661 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DESP17661 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DESP17661 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DESP17661 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DESP17661 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DESP17661 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DESP17661 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DESP17661 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DESP17661 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DESP17661 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DESP17661 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DESP17661 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DESP17661 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DESP17661 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DESP17661 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DESP17661 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DESP17661 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DESP17661 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DESP17661 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DESP17661 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DESP17661 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DESP17661 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DESP17661 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DESP17661 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DESP17661 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DESP17661 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DESP17661 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DESP17661 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DESP17661 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DESP17661 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DESP17661 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DESP17661 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DESP17661 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DESP17661 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DESP17661 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DESP17661 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DESP17661 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DESP17661 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DESP17661 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DESP17661 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DESP17661 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DESP17661 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DESP17661 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DESP17661 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DESP17661 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DESP17661 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DESP17661 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DESP17661 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DESP17661 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DESP17661 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DESP17661 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DESP17661 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DESP17661 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DESP17661 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DESP17661 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DESP17661 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DESP17661 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DESP17661 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DESP17661 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DESP17661 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DESP17661 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DESP17661 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DESP17661 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DESP17661 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
DESP17661 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms