Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms