Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRF1P14222 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRF1P14222 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRF1P14222 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRF1P14222 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRF1P14222 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRF1P14222 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRF1P14222 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRF1P14222 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRF1P14222 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRF1P14222 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRF1P14222 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRF1P14222 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRF1P14222 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRF1P14222 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRF1P14222 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRF1P14222 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRF1P14222 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRF1P14222 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRF1P14222 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRF1P14222 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRF1P14222 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRF1P14222 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRF1P14222 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRF1P14222 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRF1P14222 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRF1P14222 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRF1P14222 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRF1P14222 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PRF1P14222 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRF1P14222 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRF1P14222 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRF1P14222 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRF1P14222 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRF1P14222 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRF1P14222 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRF1P14222 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRF1P14222 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRF1P14222 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRF1P14222 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRF1P14222 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRF1P14222 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRF1P14222 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRF1P14222 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRF1P14222 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRF1P14222 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRF1P14222 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRF1P14222 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRF1P14222 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRF1P14222 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRF1P14222 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRF1P14222 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRF1P14222 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRF1P14222 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRF1P14222 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRF1P14222 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRF1P14222 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRF1P14222 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRF1P14222 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRF1P14222 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PRF1P14222 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRF1P14222 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRF1P14222 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PRF1P14222 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRF1P14222 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PRF1P14222 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRF1P14222 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRF1P14222 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRF1P14222 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRF1P14222 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRF1P14222 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRF1P14222 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRF1P14222 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRF1P14222 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRF1P14222 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRF1P14222 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRF1P14222 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRF1P14222 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRF1P14222 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRF1P14222 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRF1P14222 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRF1P14222 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRF1P14222 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRF1P14222 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRF1P14222 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRF1P14222 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRF1P14222 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRF1P14222 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRF1P14222 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRF1P14222 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRF1P14222 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRF1P14222 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRF1P14222 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRF1P14222 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRF1P14222 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRF1P14222 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRF1P14222 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRF1P14222 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRF1P14222 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRF1P14222 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms