Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms