Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3P10147 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3P10147 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3P10147 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3P10147 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3P10147 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3P10147 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3P10147 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3P10147 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3P10147 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3P10147 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3P10147 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3P10147 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3P10147 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3P10147 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3P10147 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3P10147 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3P10147 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3P10147 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3P10147 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3P10147 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3P10147 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3P10147 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3P10147 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3P10147 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3P10147 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3P10147 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3P10147 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3P10147 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3P10147 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3P10147 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3P10147 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3P10147 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3P10147 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3P10147 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3P10147 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3P10147 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3P10147 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3P10147 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3P10147 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3P10147 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3P10147 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3P10147 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3P10147 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3P10147 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3P10147 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3P10147 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3P10147 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3P10147 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3P10147 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms