Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
F13BP05160 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F13BP05160 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
F13BP05160 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
F13BP05160 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
F13BP05160 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F13BP05160 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
F13BP05160 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
F13BP05160 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
F13BP05160 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F13BP05160 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F13BP05160 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F13BP05160 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
F13BP05160 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F13BP05160 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F13BP05160 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F13BP05160 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
F13BP05160 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
F13BP05160 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F13BP05160 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F13BP05160 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
F13BP05160 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
F13BP05160 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
F13BP05160 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F13BP05160 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F13BP05160 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F13BP05160 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F13BP05160 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
F13BP05160 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F13BP05160 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F13BP05160 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
F13BP05160 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
F13BP05160 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
F13BP05160 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
F13BP05160 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
F13BP05160 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F13BP05160 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F13BP05160 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F13BP05160 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F13BP05160 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F13BP05160 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F13BP05160 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
F13BP05160 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F13BP05160 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F13BP05160 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F13BP05160 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
F13BP05160 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
F13BP05160 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
F13BP05160 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
F13BP05160 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
F13BP05160 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F13BP05160 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F13BP05160 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F13BP05160 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F13BP05160 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
F13BP05160 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
F13BP05160 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F13BP05160 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F13BP05160 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F13BP05160 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
F13BP05160 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F13BP05160 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F13BP05160 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F13BP05160 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F13BP05160 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F13BP05160 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F13BP05160 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F13BP05160 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F13BP05160 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F13BP05160 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F13BP05160 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F13BP05160 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F13BP05160 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F13BP05160 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F13BP05160 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F13BP05160 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F13BP05160 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F13BP05160 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F13BP05160 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F13BP05160 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F13BP05160 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
F13BP05160 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F13BP05160 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F13BP05160 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F13BP05160 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F13BP05160 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
F13BP05160 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F13BP05160 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F13BP05160 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F13BP05160 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F13BP05160 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F13BP05160 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F13BP05160 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F13BP05160 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F13BP05160 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F13BP05160 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F13BP05160 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F13BP05160 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F13BP05160 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F13BP05160 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms