Protein–RNA interactions for Protein: P02461

COL3A1, Collagen alpha-1(III) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL3A1P02461 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL3A1P02461 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
COL3A1P02461 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
COL3A1P02461 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL3A1P02461 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL3A1P02461 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL3A1P02461 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COL3A1P02461 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL3A1P02461 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL3A1P02461 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL3A1P02461 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL3A1P02461 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL3A1P02461 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL3A1P02461 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL3A1P02461 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COL3A1P02461 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COL3A1P02461 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL3A1P02461 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COL3A1P02461 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL3A1P02461 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COL3A1P02461 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL3A1P02461 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL3A1P02461 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COL3A1P02461 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL3A1P02461 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL3A1P02461 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL3A1P02461 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL3A1P02461 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL3A1P02461 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COL3A1P02461 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL3A1P02461 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL3A1P02461 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COL3A1P02461 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COL3A1P02461 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL3A1P02461 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
COL3A1P02461 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL3A1P02461 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COL3A1P02461 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL3A1P02461 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL3A1P02461 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL3A1P02461 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COL3A1P02461 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL3A1P02461 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COL3A1P02461 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms