Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPO95166 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPO95166 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPO95166 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPO95166 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPO95166 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPO95166 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPO95166 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPO95166 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPO95166 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPO95166 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPO95166 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPO95166 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPO95166 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPO95166 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPO95166 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPO95166 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPO95166 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPO95166 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPO95166 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPO95166 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPO95166 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPO95166 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPO95166 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPO95166 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPO95166 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPO95166 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPO95166 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPO95166 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPO95166 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPO95166 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPO95166 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPO95166 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPO95166 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPO95166 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPO95166 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPO95166 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPO95166 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPO95166 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPO95166 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPO95166 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPO95166 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPO95166 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPO95166 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPO95166 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPO95166 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPO95166 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPO95166 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPO95166 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPO95166 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPO95166 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPO95166 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPO95166 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPO95166 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPO95166 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPO95166 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPO95166 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPO95166 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPO95166 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPO95166 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPO95166 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPO95166 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPO95166 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPO95166 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPO95166 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPO95166 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPO95166 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPO95166 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPO95166 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPO95166 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPO95166 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPO95166 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPO95166 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPO95166 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPO95166 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPO95166 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPO95166 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPO95166 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPO95166 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPO95166 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPO95166 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPO95166 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPO95166 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPO95166 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPO95166 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPO95166 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPO95166 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPO95166 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPO95166 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPO95166 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPO95166 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPO95166 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPO95166 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPO95166 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPO95166 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPO95166 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPO95166 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPO95166 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPO95166 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPO95166 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms