Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms