Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms