Protein–RNA interactions for Protein: O60810

PRAMEF4, PRAME family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF4O60810 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF4O60810 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms