Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DENRO43583 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DENRO43583 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DENRO43583 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DENRO43583 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DENRO43583 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DENRO43583 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DENRO43583 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DENRO43583 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DENRO43583 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DENRO43583 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DENRO43583 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DENRO43583 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DENRO43583 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DENRO43583 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DENRO43583 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DENRO43583 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DENRO43583 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DENRO43583 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DENRO43583 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DENRO43583 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DENRO43583 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DENRO43583 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DENRO43583 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DENRO43583 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DENRO43583 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DENRO43583 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DENRO43583 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DENRO43583 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DENRO43583 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DENRO43583 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DENRO43583 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DENRO43583 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DENRO43583 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DENRO43583 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DENRO43583 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DENRO43583 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DENRO43583 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DENRO43583 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DENRO43583 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DENRO43583 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DENRO43583 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DENRO43583 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DENRO43583 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DENRO43583 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DENRO43583 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DENRO43583 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DENRO43583 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DENRO43583 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DENRO43583 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DENRO43583 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DENRO43583 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DENRO43583 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DENRO43583 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DENRO43583 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DENRO43583 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DENRO43583 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DENRO43583 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DENRO43583 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DENRO43583 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DENRO43583 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DENRO43583 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DENRO43583 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DENRO43583 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DENRO43583 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DENRO43583 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DENRO43583 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DENRO43583 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DENRO43583 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DENRO43583 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENRO43583 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENRO43583 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENRO43583 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENRO43583 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENRO43583 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENRO43583 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENRO43583 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENRO43583 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENRO43583 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENRO43583 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENRO43583 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DENRO43583 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENRO43583 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENRO43583 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENRO43583 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENRO43583 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENRO43583 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENRO43583 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENRO43583 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENRO43583 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENRO43583 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DENRO43583 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENRO43583 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENRO43583 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENRO43583 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DENRO43583 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENRO43583 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENRO43583 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENRO43583 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENRO43583 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms