Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms