Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNMO15061 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNMO15061 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNMO15061 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNMO15061 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNMO15061 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNMO15061 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNMO15061 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYNMO15061 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYNMO15061 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYNMO15061 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYNMO15061 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYNMO15061 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYNMO15061 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYNMO15061 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
SYNMO15061 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYNMO15061 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYNMO15061 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYNMO15061 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYNMO15061 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYNMO15061 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYNMO15061 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYNMO15061 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNMO15061 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNMO15061 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNMO15061 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNMO15061 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNMO15061 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNMO15061 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNMO15061 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNMO15061 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNMO15061 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNMO15061 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNMO15061 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNMO15061 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNMO15061 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNMO15061 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNMO15061 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNMO15061 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNMO15061 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNMO15061 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNMO15061 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNMO15061 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNMO15061 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNMO15061 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNMO15061 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNMO15061 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNMO15061 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNMO15061 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNMO15061 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNMO15061 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNMO15061 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNMO15061 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNMO15061 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNMO15061 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNMO15061 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNMO15061 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNMO15061 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNMO15061 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNMO15061 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNMO15061 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNMO15061 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNMO15061 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNMO15061 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNMO15061 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNMO15061 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNMO15061 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNMO15061 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNMO15061 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNMO15061 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNMO15061 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNMO15061 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNMO15061 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNMO15061 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNMO15061 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNMO15061 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNMO15061 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNMO15061 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNMO15061 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNMO15061 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNMO15061 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNMO15061 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNMO15061 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNMO15061 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNMO15061 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNMO15061 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNMO15061 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNMO15061 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNMO15061 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNMO15061 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNMO15061 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNMO15061 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNMO15061 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNMO15061 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNMO15061 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNMO15061 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNMO15061 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNMO15061 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNMO15061 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNMO15061 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms