Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APAF1O14727 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APAF1O14727 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APAF1O14727 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APAF1O14727 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APAF1O14727 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
APAF1O14727 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APAF1O14727 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APAF1O14727 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APAF1O14727 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APAF1O14727 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
APAF1O14727 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APAF1O14727 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APAF1O14727 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APAF1O14727 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APAF1O14727 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APAF1O14727 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APAF1O14727 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APAF1O14727 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APAF1O14727 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APAF1O14727 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APAF1O14727 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APAF1O14727 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APAF1O14727 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
APAF1O14727 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APAF1O14727 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APAF1O14727 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APAF1O14727 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APAF1O14727 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APAF1O14727 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APAF1O14727 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
APAF1O14727 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APAF1O14727 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APAF1O14727 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APAF1O14727 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
APAF1O14727 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APAF1O14727 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
APAF1O14727 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APAF1O14727 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APAF1O14727 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APAF1O14727 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APAF1O14727 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APAF1O14727 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APAF1O14727 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APAF1O14727 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
APAF1O14727 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
APAF1O14727 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
APAF1O14727 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
APAF1O14727 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
APAF1O14727 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APAF1O14727 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APAF1O14727 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APAF1O14727 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APAF1O14727 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APAF1O14727 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APAF1O14727 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
APAF1O14727 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APAF1O14727 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APAF1O14727 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
APAF1O14727 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
APAF1O14727 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APAF1O14727 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APAF1O14727 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APAF1O14727 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APAF1O14727 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APAF1O14727 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APAF1O14727 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APAF1O14727 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APAF1O14727 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APAF1O14727 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APAF1O14727 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APAF1O14727 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APAF1O14727 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
APAF1O14727 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APAF1O14727 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APAF1O14727 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APAF1O14727 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APAF1O14727 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APAF1O14727 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APAF1O14727 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APAF1O14727 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APAF1O14727 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APAF1O14727 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
APAF1O14727 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APAF1O14727 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APAF1O14727 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APAF1O14727 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APAF1O14727 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APAF1O14727 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
APAF1O14727 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APAF1O14727 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APAF1O14727 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APAF1O14727 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APAF1O14727 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APAF1O14727 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APAF1O14727 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APAF1O14727 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APAF1O14727 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APAF1O14727 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APAF1O14727 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms