Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms