Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms