Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MVJ9 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MVJ9 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MVJ9 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MVJ9 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MVJ9 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MVJ9 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MVJ9 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MVJ9 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MVJ9 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MVJ9 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MVJ9 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MVJ9 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MVJ9 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MVJ9 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MVJ9 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MVJ9 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MVJ9 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MVJ9 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MVJ9 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MVJ9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MVJ9 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MVJ9 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MVJ9 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MVJ9 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MVJ9 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MVJ9 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MVJ9 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MVJ9 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MVJ9 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MVJ9 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MVJ9 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MVJ9 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MVJ9 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MVJ9 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MVJ9 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MVJ9 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MVJ9 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MVJ9 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MVJ9 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MVJ9 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MVJ9 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MVJ9 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MVJ9 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MVJ9 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MVJ9 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MVJ9 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MVJ9 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MVJ9 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MVJ9 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MVJ9 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MVJ9 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MVJ9 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MVJ9 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MVJ9 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MVJ9 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MVJ9 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MVJ9 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MVJ9 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MVJ9 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MVJ9 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MVJ9 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MVJ9 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MVJ9 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MVJ9 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MVJ9 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MVJ9 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MVJ9 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MVJ9 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MVJ9 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MVJ9 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MVJ9 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MVJ9 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MVJ9 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MVJ9 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MVJ9 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MVJ9 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MVJ9 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MVJ9 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MVJ9 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MVJ9 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MVJ9 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MVJ9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MVJ9 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MVJ9 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MVJ9 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MVJ9 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MVJ9 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MVJ9 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MVJ9 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MVJ9 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MVJ9 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MVJ9 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MVJ9 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MVJ9 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MVJ9 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MVJ9 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MVJ9 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MVJ9 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MVJ9 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.5 ms