Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms