Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms