Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms