Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms