Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms