Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms