Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms