Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms