Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms