Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms