Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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