Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms