Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms