Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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