Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms