Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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