Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms